「ファイル」-「伝票データの整合機能」で処理を行う必要があります。
「区分選択」で「売上伝票」を選択し、「請求先」や「対象年月」を指定して「実行」ボタンを選択してください。
なお、誤って処理を実施した際に、データを元に戻せるように、事前にバックアップを取ってから実施することをお勧めします。